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新システム導入計画

新システムへの更新作業は全て完了しました.

更新履歴
- 2021年12月23日: 記事掲載.
- 2022年06月08日: 次期システムの情報を更新.
- 2022年08月10日: 次期システムの初期構成稼働時期,サービスの申請受付時期を更新.
次期システムの利用負担金規程,スケジュールの図を追加.
試験運用,クラウドシステムに関して補足を追記.
- 2022年10月27日:更新スケジュール,申請受付スケジュール,システム構成図,
ソフトウェア情報を更新.2023年1月~3月は試験運転期間とし,
2022年度4月~7月にご利用の方に限定したサービスとなること,
試験運転期間の利用負担金は不要であることを追記. - 2023年3月8日: 更新スケジュール等を更新
- 2023年5月15日: 更新スケジュール等を更新
- 2023年8月22日: 更新スケジュールを更新
- 2023年10月1日: 最終構成分の導入完了に伴う更新

コンテンツ

更新スケジュール

全てのシステムの正式運用を開始しています.(2023年10月1日現在)

システム構成

新システムは,前システムのコンセプトを受け継いだ3種のシステム(システムA, B, C),演算加速器を搭載した新システム(システムG),ストレージシステムにより構成されます.システムA,B,CのCPUは同一世代のIntel Xeonで統一されていますが,メモリの速度と容量に差があります.システムAはメモリの速度を重視した構成,システムBは容量と性能のバランスの良い構成,システムCはメモリ容量を重視した構成です.

system_2022.png

Camphor 3 (システムA)

全体 機種名 DELL PowerEdge C6620
ノード数 1,120
演算性能 7.63 PFlops
メモリ容量 140 TByte
ノード 演算性能 6.80 TFlops
プロセッサ数 2
メモリ容量 128 GByte
メモリバンド幅 3.2 TByte/sec
インジェクションバンド幅 50 GByte/sec
プロセッサ プロセッサ名 Intel Xeon
アーキテクチャ x86-64
演算性能 3.4 TFlops

Laurel 3 (システムB)

全体 機種名 DELL PowerEdge C6620
ノード数 370
演算性能 2.65 PFlops
メモリ容量 185 TByte
ノード 演算性能 7.17 TFlops
プロセッサ数 2
メモリ容量 512 GByte
メモリバンド幅 614 GByte/sec
インジェクションバンド幅 25 GByte/sec
プロセッサ プロセッサ名 Intel Xeon
アーキテクチャ x86-64
演算性能 3.59 TFlops

Cinnamon 3 (システムC)

全体 機種名 DELL PowerEdge C6620
ノード数 16
演算性能 114.6 TFlops
メモリ容量 32 TByte
ノード 演算性能 7.17 TFlops
プロセッサ数 2
メモリ容量 2 TByte
メモリバンド幅 563 GByte/sec
インジェクションバンド幅 25 GByte/sec
プロセッサ プロセッサ名 Intel Xeon
アーキテクチャ x86-64
演算性能 3.59 TFlops

Gardenia (システムG, 演算加速器を搭載した新システム)

全体 機種名 DELL PowerEdge XE8545
ノード数 16
演算性能(プロセッサ) 42.59 TFlops (倍精度)
メモリ容量 (プロセッサ) 8.19 TB
演算性能(演算加速器) 20.2 PFlops (半精度)
メモリ容量 (演算加速器) 5.12 TB
ノード
演算性能(プロセッサ)
2.66 TFlops (倍精度)
メモリ(プロセッサ) 512 GByte
メモリバンド幅 (プロセッサ) 409 GByte/sec
演算性能(演算加速器) 1,248 TFlops (半精度)
メモリ(演算加速器) 320 GByte
メモリバンド幅 (演算加速器) 8.15 TByte/sec
インジェクションバンド幅 50 GB/sec
プロセッサ プロセッサ名 AMD EPYC
アーキテクチャ x86-64
演算性能(倍制度) 2.66 TFlops
演算加速器 演算加速器名 NVIDIA A100 80GB SXM
演算性能(半精度) 312 TFlops
メモリ容量 80 GB
メモリバンド幅 2,039 GB/sec

クラウドシステム

全体 ノード数 変動
ノード 演算性能 3.45 TFlops
プロセッサ数 2
メモリ容量 512 GByte
プロセッサ プロセッサ名 Intel Xeon
アーキテクチャ x86-64
演算性能 1.72 TFlops

ストレージシステム

    物理容量 40.32 PB
    実効容量 31.99 PB
    データ転送性能 280 GB/sec

    高速ストレージシステム

      物理容量 4.06 PB
      実効容量 3.12 PB
      データ転送性能 768 GB/sec

        ソフトウェア

        提供ソフトウェアは以下の表のようになります.

          OS Red Hat Enterprise Linux 8
          ジョブスケジューラ Slurm
          コンパイラ Intel oneAPI (Fortran, C/C++, OpenMP)
          NVIDIA HPC SDK (Fortran, C/C++, OpenMP, CUDA)
          MPI Open MPI
          数値計算ライブラリ Intel oneAPI MKL (BLAS,LAPACK,ScaLAPACK)
          NVIDIA HPC SDK (BLAS, LAPACK, ScaLAPACK)
          機械学習フレームワーク TensorFlow, PyTorch, MXNet
          ISVアプリケーション Gaussian16, Adams, LS-DYNA, Nastran, Marc, ANSYS, Maple, Mathematica, MATLAB
          可視化/プリポスト GaussView, AVS/Express, IDL/ENVI, Marc Mentat, Patran, Tecplot

          software_stack_2022.png

           

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