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新システム導入計画
新システムへの更新作業は全て完了しました.
更新履歴
- 2021年12月23日: 記事掲載.
- 2022年06月08日: 次期システムの情報を更新.
- 2022年08月10日: 次期システムの初期構成稼働時期,サービスの申請受付時期を更新.
次期システムの利用負担金規程,スケジュールの図を追加.
試験運用,クラウドシステムに関して補足を追記.
- 2022年10月27日:更新スケジュール,申請受付スケジュール,システム構成図,
ソフトウェア情報を更新.2023年1月～3月は試験運転期間とし,
2022年度4月～7月にご利用の方に限定したサービスとなること,
試験運転期間の利用負担金は不要であることを追記. - 2023年3月8日: 更新スケジュール等を更新
- 2023年5月15日: 更新スケジュール等を更新
- 2023年8月22日: 更新スケジュールを更新
- 2023年10月1日: 最終構成分の導入完了に伴う更新
コンテンツ
更新スケジュール
全てのシステムの正式運用を開始しています.(2023年10月1日現在)
システム構成
新システムは,前システムのコンセプトを受け継いだ3種のシステム(システムA, B, C),演算加速器を搭載した新システム(システムG),ストレージシステムにより構成されます.システムA,B,CのCPUは同一世代のIntel Xeonで統一されていますが,メモリの速度と容量に差があります.システムAはメモリの速度を重視した構成,システムBは容量と性能のバランスの良い構成,システムCはメモリ容量を重視した構成です.
Camphor 3 (システムA)
| 全体 | 機種名 | DELL PowerEdge C6620 |
| ノード数 | 1,120 | |
| 演算性能 | 7.63 PFlops | |
| メモリ容量 | 140 TByte | |
| ノード | 演算性能 | 6.80 TFlops |
| プロセッサ数 | 2 | |
| メモリ容量 | 128 GByte | |
| メモリバンド幅 | 3.2 TByte/sec | |
| インジェクションバンド幅 | 50 GByte/sec | |
| プロセッサ | プロセッサ名 | Intel Xeon |
| アーキテクチャ | x86-64 | |
| 演算性能 | 3.4 TFlops |
Laurel 3 (システムB)
| 全体 | 機種名 | DELL PowerEdge C6620 |
| ノード数 | 370 | |
| 演算性能 | 2.65 PFlops | |
| メモリ容量 | 185 TByte | |
| ノード | 演算性能 | 7.17 TFlops |
| プロセッサ数 | 2 | |
| メモリ容量 | 512 GByte | |
| メモリバンド幅 | 614 GByte/sec | |
| インジェクションバンド幅 | 25 GByte/sec | |
| プロセッサ | プロセッサ名 | Intel Xeon |
| アーキテクチャ | x86-64 | |
| 演算性能 | 3.59 TFlops |
Cinnamon 3 (システムC)
| 全体 | 機種名 | DELL PowerEdge C6620 |
| ノード数 | 16 | |
| 演算性能 | 114.6 TFlops | |
| メモリ容量 | 32 TByte | |
| ノード | 演算性能 | 7.17 TFlops |
| プロセッサ数 | 2 | |
| メモリ容量 | 2 TByte | |
| メモリバンド幅 | 563 GByte/sec | |
| インジェクションバンド幅 | 25 GByte/sec | |
| プロセッサ | プロセッサ名 | Intel Xeon |
| アーキテクチャ | x86-64 | |
| 演算性能 | 3.59 TFlops |
Gardenia (システムG, 演算加速器を搭載した新システム)
| 全体 | 機種名 | DELL PowerEdge XE8545 |
| ノード数 | 16 | |
| 演算性能(プロセッサ) | 42.59 TFlops (倍精度) | |
| メモリ容量 (プロセッサ) | 8.19 TB | |
| 演算性能(演算加速器) | 20.2 PFlops (半精度) | |
| メモリ容量 (演算加速器) | 5.12 TB | |
| ノード | ||
| 演算性能(プロセッサ) |
2.66 TFlops (倍精度) | |
| メモリ(プロセッサ) | 512 GByte | |
| メモリバンド幅 (プロセッサ) | 409 GByte/sec | |
| 演算性能(演算加速器) | 1,248 TFlops (半精度) | |
| メモリ(演算加速器) | 320 GByte | |
| メモリバンド幅 (演算加速器) | 8.15 TByte/sec | |
| インジェクションバンド幅 | 50 GB/sec | |
| プロセッサ | プロセッサ名 | AMD EPYC |
| アーキテクチャ | x86-64 | |
| 演算性能(倍制度) | 2.66 TFlops | |
| 演算加速器 | 演算加速器名 | NVIDIA A100 80GB SXM |
| 演算性能(半精度) | 312 TFlops | |
| メモリ容量 | 80 GB | |
| メモリバンド幅 | 2,039 GB/sec |
クラウドシステム
| 全体 | ノード数 | 変動 |
| ノード | 演算性能 | 3.45 TFlops |
| プロセッサ数 | 2 | |
| メモリ容量 | 512 GByte | |
| プロセッサ | プロセッサ名 | Intel Xeon |
| アーキテクチャ | x86-64 | |
| 演算性能 | 1.72 TFlops |
ストレージシステム
| 物理容量 | 40.32 PB |
| 実効容量 | 31.99 PB |
| データ転送性能 | 280 GB/sec |
高速ストレージシステム
| 物理容量 | 4.06 PB |
| 実効容量 | 3.12 PB |
| データ転送性能 | 768 GB/sec |
ソフトウェア
提供ソフトウェアは以下の表のようになります.
| OS | Red Hat Enterprise Linux 8 |
| ジョブスケジューラ | Slurm |
| コンパイラ | Intel oneAPI (Fortran, C/C++, OpenMP) |
| NVIDIA HPC SDK (Fortran, C/C++, OpenMP, CUDA) | |
| MPI | Open MPI |
| 数値計算ライブラリ | Intel oneAPI MKL (BLAS,LAPACK,ScaLAPACK) |
| NVIDIA HPC SDK (BLAS, LAPACK, ScaLAPACK) | |
| 機械学習フレームワーク | TensorFlow, PyTorch, MXNet |
| ISVアプリケーション | Gaussian16, Adams, LS-DYNA, Nastran, Marc, ANSYS, Maple, Mathematica, MATLAB |
| 可視化/プリポスト | GaussView, AVS/Express, IDL/ENVI, Marc Mentat, Patran, Tecplot |
