タイプS環境のサーバに学内のネットワークから接続する場合は、proxy設定が必要となります。

FTPソフトで以下のいずれかのプロキシサーバを設定してご利用ください。

・SOCKSプロキシサーバ
ホスト名: socks-proxy.kuins.kyoto-u.ac.jp
ポート番号: 1080

・HTTPプロキシサーバ
ホスト名: proxy.kuins.kyoto-u.ac.jp
ポート番号: 8080

※FTPソフトによって、対応しているプロキシが異なりますのでご注意ください。

Windows(FFFTP),Mac(Cyberduck)の設定方法は、以下に記載しています。
FTPの設定方法(WEBホスティングサービス・タイプS)

<参考>
ファイル更新は、FTPソフトの他に、コントロールパネルからファイルマネージャーを利用して行うことも可能です。詳細は、以下URLをご確認ください。
https://help.sakura.ad.jp/206248781/